Tệp dữ liệu GB GenBank là gì?
Định dạng tệp GB còn được gọi là định dạng tệp GenBank là định dạng văn bản thuần túy tiêu chuẩn được sử dụng để lưu trữ thông tin trình tự sinh học, chẳng hạn như trình tự DNA, RNA và protein, cùng với siêu dữ liệu liên quan. Nó thường được sử dụng trong tin sinh học và sinh học phân tử để trao đổi và lưu trữ thông tin di truyền.
Thông tin định dạng tệp GB
Dưới đây là các tính năng chính của định dạng tệp GenBank:
Thông tin tiêu đề: Tệp bắt đầu bằng phần tiêu đề cung cấp thông tin về trình tự và nguồn của nó; điều này bao gồm các chi tiết như số lượng gia nhập, sinh vật và các tham chiếu đến tài liệu nơi dữ liệu trình tự được xuất bản.
Phần Tính năng: Sau tiêu đề, có phần tính năng mô tả các tính năng khác nhau của trình tự, chẳng hạn như gen, vùng mã hóa, yếu tố điều hòa và các vị trí quan trọng khác; mỗi tính năng được chú thích bằng thông tin cụ thể, chẳng hạn như vị trí của nó theo trình tự, loại tính năng và các vòng loại bổ sung.
Dữ liệu trình tự: Dữ liệu trình tự thực tế tuân theo phần tính năng; phần này chứa thông tin di truyền thô ở dạng trình tự nucleotide hoặc axit amin. Dữ liệu trình tự thường được trình bày ở định dạng chuẩn hóa có ngắt dòng để dễ đọc.
Thẻ định dạng: Tệp GenBank sử dụng các thẻ và từ khóa cụ thể để cấu trúc thông tin; những thẻ này giúp xác định các phần khác nhau của tệp và cung cấp một cách tiêu chuẩn hóa cho các chương trình phần mềm diễn giải và phân tích dữ liệu.
Chú thích: Tệp GenBank bao gồm các chú thích mở rộng cung cấp thông tin về ý nghĩa sinh học của các vùng khác nhau trong trình tự; điều này có thể bao gồm thông tin chi tiết về vùng mã hóa, sản phẩm protein và chú thích chức năng.
Dòng gốc: Dữ liệu trình tự thường được kết thúc bằng dòng “ORIGIN”, cho biết sự bắt đầu của trình tự và theo sau là trình tự nucleotide hoặc axit amin thực tế.
##Giới thiệu về phần mềm DNA Baser - Mở file GB
DNA Baser của Heracle BioSoft là một công cụ phần mềm được thiết kế để phân tích trình tự DNA. Nó chuyên tập hợp dữ liệu giải trình tự DNA, thực hiện gọi cơ sở và cho phép người dùng chỉnh sửa và chú thích các trình tự. Phần mềm cung cấp các tính năng kiểm soát chất lượng và cung cấp giao diện thân thiện với người dùng cho các nhà nghiên cứu và nhà sinh học phân tử. Nó tạo điều kiện xuất kết quả ở nhiều định dạng khác nhau để tích hợp với các công cụ và cơ sở dữ liệu tin sinh học khác, khiến nó trở thành công cụ có giá trị trong nghiên cứu sinh học phân tử và tin sinh học.
Làm cách nào để mở tệp GB?
Tệp GB liên quan đến định dạng tệp GenBank có thể được mở và tham chiếu bằng các chương trình sau.
- Heracle BioSoft DNA Baser (Bản dùng thử miễn phí) cho Windows
