Kas ir GB GenBank datu fails?
GB faila formāts, kas pazīstams arī kā GenBank faila formāts, ir standarta vienkārša teksta formāts, ko izmanto, lai saglabātu bioloģisko secību informāciju, piemēram, DNS, RNS un olbaltumvielu sekvences, kā arī saistītos metadatus. To parasti izmanto bioinformātikā un molekulārajā bioloģijā ģenētiskās informācijas apmaiņai un uzglabāšanai.
GB informācija par faila formātu
Šeit ir galvenās GenBank faila formāta funkcijas:
Galvenes informācija: fails sākas ar galvenes sadaļu, kas sniedz informāciju par secību un tās avotu; tas ietver informāciju, piemēram, pievienošanās numuru, organismu un atsauces uz literatūru, kurā tika publicēti secību dati.
Iezīmju sadaļa: aiz galvenes ir funkciju sadaļa, kurā aprakstītas dažādas secības pazīmes, piemēram, gēni, kodējošie reģioni, regulējošie elementi un citas svarīgas vietas; katrs līdzeklis ir anotēts ar konkrētu informāciju, piemēram, tā atrašanās vietu secībā, objekta veidu un papildu kvalifikatoriem.
Secības dati: Faktiskie secības dati seko funkciju sadaļai; šī sadaļa satur neapstrādātu ģenētisko informāciju nukleotīdu vai aminoskābju secību veidā. Secības dati parasti tiek parādīti standartizētā formātā ar rindiņu pārtraukumiem lasāmības nodrošināšanai.
Format Tags: GenBank files use specific tags and keywords to structure the information; these tags help define different sections of file and provide a standardized way for software programs to interpret and parse the data.
Anotācija: GenBank faili ietver plašas anotācijas, kas sniedz informāciju par dažādu secības reģionu bioloģisko nozīmi; tas var ietvert informāciju par kodēšanas reģioniem, olbaltumvielu produktiem un funkcionālām anotācijām.
Izcelsmes līnija: secības datus bieži beidz rindiņa ORIGIN, kas norāda secības sākumu, un tai seko faktiskā nukleotīdu vai aminoskābju secība.
Par DNA Baser programmatūru — lai atvērtu GB failu
Heracle BioSoft DNS Baser ir programmatūras rīks, kas paredzēts DNS sekvences analīzei. Tas specializējas DNS sekvencēšanas datu apkopošanā, bāzes izsaukšanā un ļauj lietotājiem rediģēt un anotēt sekvences. Programmatūra piedāvā kvalitātes kontroles funkcijas un nodrošina lietotājam draudzīgu saskarni pētniekiem un molekulārbiologiem. Tas atvieglo rezultātu eksportēšanu dažādos formātos integrācijai ar citiem bioinformātikas rīkiem un datu bāzēm, padarot to par vērtīgu rīku molekulārās bioloģijas un bioinformātikas pētījumos.
Kā atvērt GB failu?
GB failu, kas saistīts ar GenBank faila formātu, var atvērt un atsaukties, izmantojot šādas programmas.
- Heracle BioSoft DNA Baser (bezmaksas izmēģinājuma versija) operētājsistēmai Windows
