Apa itu file Data GB GenBank?
Format file GB juga dikenal sebagai format file GenBank adalah format teks biasa standar yang digunakan untuk menyimpan informasi urutan biologis, seperti urutan DNA, RNA, dan protein, beserta metadata terkait. Ini biasanya digunakan dalam bioinformatika dan biologi molekuler untuk pertukaran dan penyimpanan informasi genetik.
Informasi Format File GB
Berikut adalah fitur utama format file GenBank:
Informasi Header: File dimulai dengan bagian header yang memberikan informasi tentang urutan dan sumbernya; ini mencakup rincian seperti nomor aksesi, organisme, dan referensi literatur tempat data sekuens diterbitkan.
Bagian Fitur: Setelah header, terdapat bagian fitur yang menjelaskan berbagai fitur urutan, seperti gen, wilayah pengkodean, elemen pengatur, dan lokasi penting lainnya; setiap fitur diberi keterangan dengan informasi spesifik, seperti lokasinya pada urutan, jenis fitur, dan kualifikasi tambahan.
Data Urutan: Data urutan sebenarnya mengikuti bagian fitur; bagian ini berisi informasi genetik mentah berupa rangkaian nukleotida atau asam amino. Data urutan biasanya disajikan dalam format standar dengan jeda baris agar mudah dibaca.
Format Tag: File GenBank menggunakan tag dan kata kunci tertentu untuk menyusun informasi; tag ini membantu menentukan bagian file yang berbeda dan menyediakan cara standar bagi program perangkat lunak untuk menafsirkan dan menguraikan data.
Anotasi: File GenBank menyertakan anotasi ekstensif yang memberikan informasi tentang signifikansi biologis berbagai wilayah secara berurutan; ini dapat mencakup detail tentang wilayah pengkodean, produk protein, dan anotasi fungsional.
Garis Asal: Data sekuens sering kali diakhiri dengan garis “ORIGIN”, yang menunjukkan awal sekuens dan diikuti oleh sekuens nukleotida atau asam amino sebenarnya.
Tentang Perangkat Lunak DNA Baser - Untuk membuka file GB
DNA Baser oleh Heracle BioSoft adalah alat perangkat lunak yang dirancang untuk analisis urutan DNA. Ia mengkhususkan diri dalam mengumpulkan data pengurutan DNA, melakukan panggilan dasar, dan memungkinkan pengguna untuk mengedit dan memberi anotasi pada urutan. Perangkat lunak ini menawarkan fitur kontrol kualitas dan menyediakan antarmuka yang ramah pengguna bagi para peneliti dan ahli biologi molekuler. Ini memfasilitasi ekspor hasil dalam berbagai format untuk diintegrasikan dengan alat dan database bioinformatika lainnya, menjadikannya alat yang berharga dalam penelitian biologi molekuler dan bioinformatika.
Bagaimana cara membuka file GB?
File GB yang terkait dengan format file GenBank dapat dibuka dan direferensikan menggunakan program berikut.
- Heracle BioSoft DNA Baser (Uji Coba Gratis) untuk Windows
