מהו קובץ GB GenBank Data?
פורמט קובץ GB הידוע גם כפורמט קובץ GenBank הוא פורמט סטנדרטי של טקסט רגיל המשמש לאחסון מידע על רצף ביולוגי, כגון רצפי DNA, RNA וחלבונים, יחד עם מטא נתונים משויכים. הוא נפוץ בשימוש בביואינפורמטיקה ובביולוגיה מולקולרית להחלפה ואחסון של מידע גנטי.
מידע על פורמט קובץ GB
להלן תכונות מפתח של פורמט קובץ GenBank:
מידע על הכותרת: הקובץ מתחיל בקטע כותרת שמספק מידע על הרצף והמקור שלו; זה כולל פרטים כגון מספר גישה, אורגניזם והפניות לספרות שבה פורסמו נתוני רצף.
קטע תכונות: לאחר הכותרת, ישנו קטע תכונות המתאר תכונות שונות של רצף, כגון גנים, אזורי קידוד, אלמנטים רגולטוריים ומיקומים חשובים אחרים; כל תכונה מסומנת במידע ספציפי, כגון מיקומה לפי הרצף, סוג התכונה ומאפיינים מתאימים נוספים.
נתוני רצף: נתוני הרצף בפועל עוקבים אחר סעיף התכונות; חלק זה מכיל מידע גנטי גולמי בצורה של רצפי נוקלאוטידים או חומצות אמינו. נתוני הרצף מוצגים בדרך כלל בפורמט סטנדרטי עם מעברי שורות לקריאה.
פורמט תגיות: קבצי GenBank משתמשים בתגיות ומילות מפתח ספציפיות כדי לבנות את המידע; תגים אלו עוזרים להגדיר קטעים שונים של קובץ ומספקים דרך סטנדרטית לתוכנות לפרש ולנתח את הנתונים.
ביאור: קבצי GenBank כוללים הערות נרחבות המספקות מידע על המשמעות הביולוגית של אזורים שונים ברצף; זה יכול לכלול פרטים על אזורי קידוד, מוצרי חלבון והערות פונקציונליות.
שורת מקור: נתוני הרצף מסתיימים לעתים קרובות על ידי קו “ORIGIN”, המציין את תחילת הרצף ואחריו רצף נוקלאוטידים או חומצות אמינו בפועל.
אודות תוכנת DNA Baser - לפתיחת קובץ GB
DNA Baser מאת Heracle BioSoft הוא כלי תוכנה המיועד לניתוח רצף DNA. היא מתמחה בהרכבת נתוני רצף DNA, ביצוע קריאות בסיס, ומאפשרת למשתמשים לערוך ולערוך רצפים. התוכנה מציעה תכונות בקרת איכות ומספקת ממשק ידידותי למשתמש עבור חוקרים וביולוגים מולקולריים. זה מאפשר ייצוא של תוצאות בפורמטים שונים לאינטגרציה עם כלים ומסדי נתונים ביואינפורמטיקה אחרים, מה שהופך אותו לכלי בעל ערך בביולוגיה מולקולרית וביואינפורמטיקה.
איך פותחים קובץ GB?
ניתן לפתוח קובץ GB הקשור לפורמט קובץ GenBank ולהפנות אליו באמצעות התוכניות הבאות.
- Heracle BioSoft DNA Baser (ניסיון חינם) עבור Windows
