Comhaid PDB a Thuiscint: Uirlis Ríthábhachtach don Bhitheolaíocht Struchtúrtha
I réimse na bitheolaíochta struchtúracha, feidhmíonn an Banc Sonraí Próitéine (PDB) mar acmhainn luachmhar d’eolaithe agus do thaighdeoirí. Tá ról lárnach ag comhaid PDB, an fhormáid chaighdeánaithe chun struchtúir thríthoiseach (3D) próitéiní agus macramóilíní eile a stóráil, maidir lena gcomhordanáidí adamhacha a shoiléiriú agus léargais a sholáthar ar a bhfeidhm. San Airteagal seo, déanfaimid iniúchadh ar shaol na comhaid PDB, ag fiosrú a dtábhacht, a struchtúr, agus an saibhreas eolais a chuireann siad ar fáil don phobal eolaíoch.
Cad is Comhaid PDB ann?
Is comhaid gnáth-théacs iad comhaid PDB ina bhfuil faisnéis mhionsonraithe faoi na comhordanáidí adamhach, faid naisc, uillinneacha, agus sonraí riachtanacha eile a shainíonn struchtúr 3D mhacramóilín. Úsáidtear go forleathan iad chun sonraí struchtúracha a stóráil agus a roinnt, ag cinntiú in-atáirgthe agus ag éascú comhoibrithe i measc taighdeoirí ar fud an domhain.
Struchtúr Comhad PDB - Formáid Chomhaid PDB
Cuimsíonn gnáthchomhad PDB ilchodanna, gach ceann ag freastal ar shainchuspóir laistigh den Formáid Comhaid PDB. Áirítear ar na hailt riachtanacha:
- Header: Contains general information about the structure, such as the title, author, and publication details.
- Rannóg chomhordanáidí: Cuireann sé na comhordanáidí adamhach agus faisnéis ghaolmhar i láthair, lena n-áirítear cineál na dúil, áitíocht agus fachtóir teochta.
- Rannán nascachta: Sainmhínítear an nascacht idir adaimh, naisc, agus topology foriomlán an mhacramóilín.
- Rannán anótála: Soláthraíonn sé sonraí breise cosúil le heilimintí de struchtúr tánaisteach próitéine, ligands, agus móilíní tuaslagóirí atá sa struchtúr.
- Rannán criostail: Áirítear leis sin faisnéis ar na paraiméadair chriostalagrafacha a úsáidtear chun an struchtúr a chinneadh (más infheidhme).
- Rannán Nótaí: Ligeann sé do thuairimí nó do thuairimí roghnacha maidir leis an struchtúr.
Tábhacht Comhaid PDB:
Feidhmíonn comhaid PDB mar bhunchloch na bitheolaíochta struchtúracha agus cuireann siad go leor buntáistí ar fáil:
- Anailís Struchtúrtha: Cuireann comhaid PDB ar chumas taighdeoirí staidéar a dhéanamh ar struchtúr 3D próitéiní agus macramóilíní, ag tabhairt léargais ríthábhachtacha ar a bhfillte, a bhfeidhm agus a n-idirghníomhaíochtaí le móilíní eile.
- Fionnachtain Drugaí: Cabhraíonn comhaid PDB le spriocanna féideartha drugaí a shainaithint trí ligean d’eolaithe suíomhanna ceangailteacha próitéiní a fheiceáil agus móilíní a dhearadh ar féidir leo a ngníomhaíocht a mhodhnú.
- Staidéir Chomparáideacha: Éascaíonn comhaid PDB anailís chomparáideach ar struchtúir ghaolmhara, ag cuidiú le taighdeoirí caidrimh éabhlóideacha a thuiscint agus móitífeanna struchtúracha caomhnaithe a aithint.
- Bailíochtú agus Rialú Cáilíochta: Ligeann infhaighteacht comhaid PDB do bhailíochtú neamhspleách agus fíorú struchtúir foilsithe, ag cur trédhearcacht agus déine eolaíoch chun cinn.
- Oideachas agus For-Rochtain: Is uirlisí oideachais luachmhara iad comhaid PDB, a ligeann do mhic léinn agus don phobal i gcoitinne domhan casta na struchtúr móilíneach a iniúchadh agus a shamhlú.
Cineálacha éagsúla Comhaid PDB:
Úsáidtear comhaid PDB (Banc Sonraí Próitéin) go coitianta chun faisnéis struchtúrach tríthoiseach a stóráil faoi bhithmhóilíní, go príomha próitéiní agus aigéid núicléacha. Tá roinnt cineálacha éagsúla comhad PDB ann, gach ceann ag freastal ar shainchuspóir. Seo cuid de na cineálacha coitianta:
- Cinneadh Struchtúr PDB (formáid mmCIF): Seo an fhormáid chaighdeánach comhaid PDB a úsáidtear chun struchtúir tríthoiseacha bithmhóilíní arna chinneadh go turgnamhach a léiriú. Tá faisnéis ann faoi chomhordanáidí adamhach na n-adamh sa mhóilín, chomh maith le meiteashonraí a bhaineann leis an bpróiseas um chinneadh struchtúir.
- Samhail PDB: I gcásanna áirithe, tá samhlacha iolracha nó comhréireanna de struchtúr bithmhóilíneach ar fáil. Is ionann comhaid mhúnla PDB agus ensemble de struchtúir, gach ceann acu lena shraith féin de chomhordanáidí adamhach. Úsáidtear na comhaid seo chun dinimic nó comhréireanna malartacha móilín a léiriú.
- NMR PDB: Léiríonn comhaid PDB Athshondais Mhaighnéadaigh Núicléach (NMR) go sonrach struchtúir arna gcinneadh ag baint úsáide as speictreascópacht NMR. Soláthraíonn turgnaimh NMR faisnéis faoi na faid idir adaimh i móilín, agus tá faisnéis i gcomhaid NMR PDB faoi na hachair seo, chomh maith leis na comhordanáidí adamhach díorthaithe.
- Móilín Beag PDB: Cé go n-úsáidtear comhaid PDB go príomha le haghaidh próitéiní agus aigéid núicléacha, is féidir leo faisnéis struchtúrach a stóráil freisin faoi mhóilíní beaga, amhail comhdhúile drugaí nó ligands. Cuimsíonn comhaid PDB móilíní beaga comhordanáidí adamhach an mhóilín bhig agus aon mheiteashonraí gaolmhara.
- Sonraí Turgnamhach PDB: Is féidir le comhaid PDB sonraí turgnamhacha a bhaineann le struchtúr bithmhóilíneach a stóráil freisin, amhail sonraí díraonta ó thurgnaimh chriostalagrafaíochta X-gha. Tá faisnéis sna comhaid seo faoin socrú turgnamhach agus na patrúin díraonta breathnaithe.
- PDB anótáilte: Tá faisnéis bhreise thar na comhordanáidí adamhach i gcomhaid PDB anótáilte. Féadfaidh siad nótaí a áireamh faoi fhearann próitéine, eilimintí struchtúir tánaisteacha, suíomhanna ceangailteacha ligand, agus gnéithe feidhmiúla nó struchtúracha eile an mhóilín.
- Comhaid Hoimeolaíochta/Samhaltaithe Comparáideach PDB: Gintear comhaid PDB hoimeolaíochta nó samhaltaithe comparáidí nuair a thuar struchtúr próitéine nó macramóilíní bunaithe ar a chosúlachtaí seicheamh le struchtúr aithnidiúil arna chinneadh go turgnamhach. Soláthraíonn na comhaid seo léargais luachmhara ar ghnéithe struchtúracha agus ar fheidhmeanna féideartha próitéiní nach bhfuil struchtúir thurgnamhacha iontu.
- Comhaid Teoiriciúla/Ríomhaireachta PDB: Gintear comhaid PDB teoiriciúla nó ríomhaireachtúla trí úsáid a bhaint as modhanna ríomhaireachtúla amhail insamhaltaí dinimic mhóilíneach nó algartaim tuartha struchtúir próitéine. Léiríonn na comhaid seo struchtúir tuartha agus is féidir leo faisnéis luachmhar a sholáthar maidir le dinimic próitéine, cosáin fillte, agus idirghníomhaíochtaí le ligands nó móilíní eile.
- Comhaid Hibrid PDB: Comhcheanglaíonn comhaid hibrideacha PDB sonraí turgnamhacha agus ríomhaireachtúla chun léiriú níos cuimsithí a sholáthar ar struchtúr macramóilín. Ionchorpraíonn siad sonraí turgnamhacha, mar shampla íomhánna micreascópachta leictreoin ísealtaifigh nó sonraí scaipthe X-ghathanna beaga (SAXS), le samhlacha ríomhaireachtúla chun struchtúir hibrideacha a ghintear gnéithe turgnamhacha agus tuartha araon.
- Comhaid PDB faoi Cheangal Ligand: Tá struchtúir 3D de phróitéiní nó de mhacramóilíní coimpléascacha le móilíní beaga, amhail drugaí, comhfhachtóirí, nó foshraitheanna i gcomhaid PDB faoi cheangal Ligand. Soláthraíonn na comhaid seo léargais ríthábhachtacha ar idirghníomhaíochtaí próitéine-ligand, ag cuidiú le tuiscint ar cheangail drugaí agus dearadh réasúnach drugaí.
- ** Comhaid PDB Ensemble:** Is éard atá i gcomhaid Ensemble PDB ná bailiúchán de shamhlacha atá cosúil le struchtúr a ghabhann solúbthacht nó dinimic bhunúsach mhacramóilín. Is minic a úsáidtear iad chun staidéar a dhéanamh ar athruithe comhfhoirmithe, ar dhinimic próitéine, nó chun stáit feidhmiúla éagsúla móilín a léiriú.
RCSB PDB
Is acmhainn aitheanta agus údarásach go forleathan é an RCSB PDB (Comhoibriú Taighde do Bhanc Sonraí Próitéiní Bithfhaisnéisíochta Struchtúrtha) chun rochtain agus iniúchadh a dhéanamh ar fhaisnéis struchtúrach 3D ar mhacramóilíní bitheolaíocha. Is é an stór príomhúil do shonraí PDB agus feidhmíonn sé mar lárionad do thaighde struchtúrach na bitheolaíochta.
Seo roinnt príomhghnéithe agus faisnéis faoin RCSB PDB:
Stór Sonraí: Feidhmíonn bunachar sonraí RCSB PDB mar stór do struchtúir 3D a chinntear go turgnamhach de phróitéiní, aigéid núicléacha, agus tionóil chasta. Stórálann sé bailiúchán mór de chomhaid PDB, ina bhfuil comhordanáidí adamhach, sonraí turgnamhacha, nótaí agus faisnéis ábhartha eile.
Comhoibriú Domhanda: Is iarracht chomhoibríoch é an RCSB PDB a bhaineann le hinstitiúidí iolracha, lena n-áirítear Ollscoil Rutgers, Ollscoil California, San Diego, Ollscoil California, San Francisco, agus an Institiúid Náisiúnta um Chaighdeáin agus Teicneolaíocht (NIST). Cinntíonn an comhoibriú cothabháil leanúnach, coimeád agus rochtain ar bhunachar sonraí an PDB.
Inrochtaineacht agus Comhéadan Úsáideora: Soláthraíonn an RCSB PDB comhéadan gréasáin so-úsáidte (www.rcsb.org) a ligeann do thaighdeoirí, eolaithe, agus an pobal i gcoitinne sonraí struchtúracha a chuardach, a bhrabhsáil agus a aisghabháil. Tairgeann an suíomh Gréasáin roghanna cuardaigh éagsúla, ardchumais ceisteanna, agus uirlisí le haghaidh léirshamhlú agus anailíse.
Comhtháthú Sonraí agus Crosthagairt: Comhtháthaíonn PDB an RCSB sonraí ó fhoinsí agus bunachair shonraí éagsúla, rud a chuireann ar chumas úsáideoirí rochtain a fháil ar fhaisnéis bhreise a bhaineann le struchtúir shonracha. Déanann sé crostagairtí ar bhunachair shonraí bitheolaíocha eile, mar shampla UniProt, Pfam, Gene Ontology, agus PubMed, ag tabhairt léargas cuimsitheach ar ghnéithe struchtúracha agus feidhmiúla mhacramóilíní.
Uirlisí agus Acmhainní: Cuireann suíomh Gréasáin RCSB PDB raon uirlisí agus acmhainní ar fáil chun tacú le hanailís struchtúrach agus léirshamhlú. Ina measc seo tá lucht féachana móilíneach, uirlisí ailínithe, uirlisí cuardaigh seichimh, agus seirbhísí bailíochtaithe, i measc nithe eile. Éascaíonn na hacmhainní seo taiscéalaíocht agus léirmhíniú sonraí struchtúracha.
Oideachas agus For-Rochtain: Tá PDB an RCSB tiomanta do thionscnaimh oideachais agus for-rochtana a chur chun cinn. Soláthraíonn an suíomh Gréasáin acmhainní oideachais, ranganna teagaisc, agus ábhair ranga chun cabhrú le mic léinn, oideachasóirí agus an pobal i gcoitinne struchtúir mhóilíneacha agus a dtábhacht a thuiscint.
Continuous Updates and Improvements: Déantar PDB an RCSB a nuashonrú go leanúnach le struchtúir nua de réir mar a bhíonn siad ar fáil. Téann sé faoi phróisis rialta cothabhála agus rialaithe cáilíochta chun cruinneas agus sláine na sonraí stóráilte a chinntiú. Déantar iarrachtaí freisin taisceadh sonraí, coimeád agus comhtháthú sonraí a fheabhsú chun tacú le taighde eolaíoch.
Is acmhainn chuimsitheach é RCSB PDB a sholáthraíonn rochtain oscailte ar shonraí struchtúracha 3D macramóilíní bitheolaíocha. Is é an misean atá aige ná taighde a éascú, fionnachtain eolais a chumasú, agus comhoibriú eolaíoch a chothú i réimse na bitheolaíochta struchtúracha.
Tábhacht Bhunachar Sonraí PDB
Feidhmíonn an bunachar sonraí PDB mar thaisc láraithe do shonraí struchtúracha 3D, a sholáthraíonn saibhreas faisnéise agus léargais do thaighdeoirí ar dhomhan casta na macramóilíní. Is féidir achoimre a dhéanamh ar a thábhacht mar seo a leanas:
- Caidreamh Struchtúr-Feidhm: Cuireann bunachar sonraí an PDB ar chumas taighdeoirí an gaol idir struchtúr agus feidhm próitéiní agus macramóilíní eile a aimsiú. Trí staidéar a dhéanamh ar na comhordanáidí adamhach 3D, is féidir le taighdeoirí léargais luachmhara a fháil ar na meicníochtaí is bun le próisis bhitheolaíocha agus feidhmeanna ceallacha.
- Fionnachtain agus Dearadh Drugaí: Cabhraíonn bunachar sonraí an PDB le fáil amach agus dearadh drugaí trí mhioneolas a sholáthar faoi shuíomhanna ceangailteacha próitéiní agus a n-idirghníomhaíochtaí le móilíní beaga. Ligeann an t-eolas seo do thaighdeoirí oibreáin theiripeacha nua a fhorbairt a dhíríonn ar phróitéiní sonracha a bhfuil baint acu le galair.
- Anailís Chomparáideach agus Staidéir Éabhlóideacha: Ceadaíonn bunachar sonraí an PDB d’anailís chomparáideach ar struchtúir ghaolmhara, ag éascú sainaithint móitífeanna struchtúracha caomhnaithe agus caidrimh éabhlóideacha. Cuidíonn an t-eolas seo le taighdeoirí tuiscint a fháil ar na caidrimh idir teaghlaigh próitéine éagsúla agus a n-impleachtaí feidhmiúla.
- Bailíochtú agus Rialú Cáilíochta: Cuireann infhaighteacht bhunachar sonraí PDB trédhearcacht agus déine eolaíoch chun cinn trí bhailíochtú neamhspleách agus fíorú struchtúir foilsithe a cheadú. Is féidir le taighdeoirí crostagairt a dhéanamh ar a múnlaí turgnamhacha nó ríomhaireachtúla féin agus na struchtúir atá acu cheana féin agus iad a chur i gcomparáid lena chéile, ag cinntiú cruinneas agus iontaofacht.
Eagrú agus Ábhar Bhunachar Sonraí PDB:
Tá an bunachar sonraí PDB eagraithe bunaithe ar struchtúr ordlathach, agus léiríonn gach iontráil struchtúr uathúil 3D. I measc na bpríomhchodanna de bhunachar sonraí PDB tá:
- PDB ID and Entry Information: Each entry in the PDB database is assigned a unique identifier known as the PDB ID. This ID is used to access and reference specific structures within the database. Entry information includes details about the deposition date, authors, experimental techniques employed, and associated publication-gas.
- ** Comhordanáidí Adamhacha agus Meiteashonraí:** Is é croílár gach iontrála sa bhunachar sonraí PDB an chuid comhordanáidí adamhach, a sholáthraíonn suíomhanna spásúla gach adaimh sa mhacramóilín. Tá meiteashonraí ar nós B-fhachtóirí (fachtóirí teochta), luachanna áitíochta, agus sonraí turgnamhacha breise ag gabháil leis an gcuid seo.
- Anótálacha Feidhmiúla agus Comhthéacs Bitheolaíochta: Tá faisnéis i mbunachar sonraí an PDB maidir le comhthéacs bitheolaíoch gach struchtúir, lena n-áirítear nótaí feidhmiúla, ligands, comhfhachtóirí, agus comhpháirtithe idirghníomhaíochta. Cuireann mionsonraí den sórt sin lenár dtuiscint ar ról an struchtúir i bpróisis bhitheolaíocha.
- Comhtháthú Sonraí agus Cros-tagairtí: Comhtháthaíonn bunachar sonraí an BFC le bunachair shonraí bitheolaíocha eile, rud a ligeann do thaighdeoirí teacht ar fhaisnéis ábhartha bhreise. Soláthraíonn crostagairtí do bhunachair shonraí mar UniProt, Gene Ontology, agus an Coimisiún Einsím faisnéis chuimsitheach d’úsáideoirí faoi sheichimh próitéine, nótaí feidhmiúla, agus litríocht ghaolmhar.
Rochtain agus Úsáid a bhaint as Bunachar Sonraí PDB:
Is féidir le taighdeoirí rochtain a fháil ar an bhunachar sonraí PDB trí bhealaí éagsúla, lena n-áirítear an suíomh Gréasáin oifigiúil (www.rcsb.org), a sholáthraíonn comhéadan atá éasca le húsáid chun struchtúir chuardaigh, bhrabhsála agus aisghabhála. Ina theannta sin, ceadaíonn roinnt uirlisí bogearraí agus acmhainní, idir ghréasánbhunaithe agus neamhspleách, anailís dhomhain, léirshamhlú agus ionramháil sonraí PDB.
Cuireann na huirlisí seo ar chumas taighdeoirí:
- Search for Structures: Users can search for specific structures based on PDB IDs, keywords, author names, or sequence similarity to known structures.
- Amharc ar Struchtúir: Ligeann bogearraí móilíneacha léirshamhlaithe do thaighdeoirí struchtúir 3T a shamhlú agus a iniúchadh, rud a chumasaíonn tuiscint níos fearr ar shocrú spásúil na n-adamh, na n-eilimintí struchtúr tánaisteacha, agus na hidirghníomhaíochtaí próitéin-ligand.
- Déan Anailís agus Déan Comparáid: Cuidíonn uirlisí anailíse éagsúla le struchtúir a chur i gcomparáid agus a anailísiú, móitífeanna caomhnaithe a aithint, cosúlachtaí struchtúracha a bhrath, agus measúnú a dhéanamh ar athruithe struchtúracha idir stáit éagsúla mhacramóilín.
- Aisghabh Sonraí Tacaíochta: Is féidir le taighdeoirí rochtain a fháil ar shonraí turgnamhacha gaolmhara, ar fhoilseacháin agus ar fhaisnéis bhreise a bhaineann le struchtúir shonracha i mbunachar sonraí an PDB.
Leanann an bunachar sonraí PDB ag forbairt agus ag leathnú, ag coinneáil suas le dul chun cinn i dteicnící turgnamhacha agus i modhanna ríomhaireachtúla. Cuireann teicneolaíochtaí nua, mar mhicreascópacht chrió-leictreoin (cryo-EM) agus cur chuige comhtháite bitheolaíochta struchtúracha, le líon méadaitheach de struchtúir ardtaifigh atá á dtaisceadh i mbunachar sonraí PDB. Ina theannta sin, tá iarrachtaí ar bun chun comhtháthú sonraí a fheabhsú, cáilíocht sonraí a fheabhsú, agus comhtháthú faisnéise feidhme agus comhthéacs laistigh den bhunachar sonraí a éascú.
Seasann an bunachar sonraí Banc Sonraí Próitéine (PDB) mar chloch choirnéil na bitheolaíochta struchtúracha, ag soláthar bailiúchán ollmhór de struchtúir mhacramóilíní 3D arna gcinneadh go turgnamhach do thaighdeoirí. Trína raidhse sonraí agus cumais crostagartha, cuireann bunachar sonraí an PDB le fionnachtana eolaíocha, éascaíonn sé forbairt drugaí, agus cothaíonn sé comhoibriú i measc taighdeoirí ar fud an domhain. De réir mar a théann réimse na bitheolaíochta struchtúracha chun cinn, fanfaidh bunachar sonraí an PDB mar acmhainn fíor-riachtanach, ag nochtadh rúin na struchtúr móilíneach agus ag catalú dul chun cinn i ndisciplíní eolaíocha éagsúla.
Conas comhaid PDB a oscailt?
Chun comhaid PDB a oscailt, is féidir leat uirlisí bogearraí éagsúla agus lucht féachana a úsáid atá deartha go sonrach le haghaidh léirshamhlú agus anailíse móilíneach. Seo roinnt roghanna a úsáidtear go coitianta:
PyMOL: Is bogearraí léirshamhlaithe móilíneacha coitianta é PyMOL a ligeann duit comhaid PDB a oscailt agus a anailísiú. Tairgeann sé comhéadan atá éasca le húsáid le gnéithe fairsinge chun struchtúir mhóilíneacha a léirshamhlú agus a ionramháil. Tá PyMOL ar fáil mar leaganacha foinse oscailte agus tráchtála araon.
Chimera: Is uirlis chumhachtach bogearraí é UCSF Chimera chun struchtúir mhóilíneacha a léirshamhlú agus a anailísiú. Tacaíonn sé le raon leathan de formáidí comhaid, lena n-áirítear comhaid PDB. Soláthraíonn Chimera sraith chuimsitheach uirlisí le haghaidh grafaicí móilíneacha, tógáil samhlacha, agus iniúchadh idirghníomhach ar mhacramóilíní.
VMD (Dinimic Mhóilíneach Amhairc): Is bogearraí samhaltú agus ionsamhlúcháin mhóilíneacha é VMD a thacaíonn le comhaid PDB i measc formáidí eile. Tá sé an-úsáideach chun staidéar a dhéanamh ar chórais bhithmhóilíneacha agus chun insamhaltaí dinimic mhóilíneach a dhéanamh. Cuireann VMD ardchumais léirshamhlaithe agus uirlisí anailíse ar fáil.
Jmol: Is breathnóir móilíneach foinse oscailte é Jmol atá bunaithe ar Java ar féidir leis comhaid PDB a oscailt. Ceadaíonn sé léirshamhlú idirghníomhach ar struchtúir mhóilíneacha agus cuireann sé gnéithe ar fáil chun achair a zúmáil, a rothlú agus a thomhas. Is féidir Jmol a úsáid mar fheidhmchlár neamhspleách nó leabaithe i suíomhanna Gréasáin.
UCSF ChimeraX: Is é ChimeraX an clár léirshamhlaithe móilíneach den chéad ghlúin eile atá forbartha ag an bhfoireann chéanna taobh thiar de Chimera. Soláthraíonn sé comhéadan úsáideora feabhsaithe, cumais léirshamhlaithe feabhsaithe, agus tacaíocht do thacair sonraí ar scála mór. Tá ChimeraX in ann comhaid PDB a oscailt agus cuireann sé arduirlisí ar fáil le haghaidh anailíse struchtúir agus léirshamhlú.
Biovia Discovery Studio: Is sraith chuimsitheach uirlisí samhaltaithe agus ionsamhlúcháin é Biovia Discovery Studio a úsáidtear go forleathan i dtaighde bitheolaíochta móilíneach. Tacaíonn sé le comhaid PDB a oscailt agus a anailísiú agus cuireann sé raon de chumais samhaltaithe agus anailíse móilíneacha ar fáil.
Conclúid:
Cuireann éagsúlacht na gcomhad PDB, ó struchtúir thurgnamhach go samhlacha tuartha, speictream leathan eolais ar fáil do thaighdeoirí i réimse na bitheolaíochta struchtúracha. Cibé an bhfuil siad díorthaithe ó theicnící turgnamhacha nó ó mhodhanna ríomhaireachtúla, soláthraíonn na comhaid seo bunús le staidéar a dhéanamh ar struchtúir próitéine, meicníochtaí feidhmiúla a shoiléiriú, agus iarrachtaí fionnachtana drugaí a éascú. Cuireann infhaighteacht agus úsáid cineálacha éagsúla comhad PDB le cur chun cinn na bitheolaíochta struchtúracha agus bíonn tionchar mór aige ar dhisciplíní eolaíocha éagsúla.